A vastagbéltükrözés kellemetlenségekkel, akár fájdalommal is járhat. A vizsgálat során előfordulhat hasi kellemetlen érzés, görcs, puffadás. A bódításban vagy altatásban végzett vizsgálat azonban fájdalommentes. A kellemetlen érzést elsősorban a vastagbél felfújásából származó feszítés, puffadás okozza. Az orvos egyénre szabottan, fokozatosan adagolja a végbélen át a felfújásra alkalmazott levegőt vagy szén-dioxidot, az Ön visszajelzései alapján pedig azt módosítani is tudja. A felfújás a vizsgálat során elkerülhetetlen, ugyanis, ha összetapadnak a bélfalak, a vizsgáló orvos nem tudja átvizsgálni a bél nyálkahártyáját, és tovább sem tud haladni a bélben a vizsgálóeszközzel. Az asszisztensek pozícióváltással, illetve a hasra gyakorolt finom nyomással igyekeznek könnyíteni a vizsgálat menetét, csökkenteni a kellemetlenségeket. Szükség szerint fájdalomcsillapítás kérhető a beavatkozás során. Fontos, hogy bátran jelezze, hogy mikor mit érez.